Вагит Юсуфович Алекперов родился 1 сентября 1950 г. в поселке Разина, расположенном недалеко от Баку, в семье азербайджанца и русской казачки – младшим из пятерых детей. Его отец, работавший сначала слесарем на нефтепромыслах, а потом в местном исполкоме, умер, когда Вагиту было три года.